全球知名的工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)解決方案提供商研華科技近日宣布發(fā)布與偉薩科技技術(shù)共同創(chuàng)建的DNA基因排序加速解決方案。該解決方案解決了大中華區(qū)和北美地區(qū)對非侵入性產(chǎn)前檢查(NIPT)和癌癥和疾病診斷市場日益增長的需求。
“下一代測序(NGS)”是近年來備受關(guān)注的基因技術(shù)。通過比較和分析DNA序列,NGS根據(jù)人類基因組數(shù)據(jù)庫精確定制治療方案。NGS通過定位存儲與潛在原因相關(guān)的信息來幫助醫(yī)療人員防止傳播和感染,對抗癌癥和罕見疾病。然而,產(chǎn)生了一個問題,基因服務(wù)提供者面臨著越來越大的挑戰(zhàn):處理無休止的基因組數(shù)據(jù)。這個耗時耗力的過程阻礙了研究和進展。
為了應(yīng)對這一挑戰(zhàn),研華科技與偉薩科技,一家專長在基因組測序加速的臺灣公司,共同開發(fā)了一種加速解決方案。通過將研華SKY-7210服務(wù)器與偉薩科技的FPGA卡相結(jié)合,專為精密醫(yī)療行業(yè)設(shè)計出一種優(yōu)化和加速數(shù)據(jù)處理的基因測序一體式服務(wù)器。
借助這個高速平臺,種系分析管道處理時間最多可縮短25小時,從近33小時縮短到不足8小時,從而大大提高了效率并降低了TCO(總經(jīng)營成本)。該基因排序加速解決方案現(xiàn)在已經(jīng)在研究機構(gòu)、生物庫、診所和醫(yī)院開始使用,在基因組數(shù)據(jù)分析方面提供了更大的靈活性,并提升了精確醫(yī)學(xué)的價值。
基因排序加速解決方案
基因排序加速解決方案提供一個無痛的升級過程,使用本地BWA-MEM和GATK處理種系管道的二次分析。使用者可以在不更改工作流的情況下完成對齊、排序、標記復(fù)制和變量調(diào)用的分析。隨著本機快速算法的加速,SNPs和INDELs的整體精度為99.9%,與原始軟件相同。此外,加速解決方案提供與原始軟件完全相同的輸出文件格式。
基因排序加速解決方案為在服務(wù)器上部署大數(shù)據(jù)和深度學(xué)習(xí)提供了一個平臺,該服務(wù)器具有3TB DDR4插槽、3 x NMC(網(wǎng)絡(luò)夾層卡)和2 x 300W GPU或6 x 150W GPU,以減少從HDD到FPGA的數(shù)據(jù)移動延遲。連接更靈活,更容易適應(yīng)未來的擴展。
【關(guān)于研華】
研華科技成立于1983年,以“智能地球的推手”作為品牌愿景,專注在工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)和智慧城市產(chǎn)業(yè),提供軟硬件整合解決方案。研華業(yè)務(wù)分布全球26個國家,擁有近8,000名員工,以強大的技術(shù)服務(wù)及營銷網(wǎng)絡(luò),為客戶提供本土化響應(yīng)的便捷服務(wù)。同時,研華智能系統(tǒng)推出“IPC+N+S”策略,深化行業(yè)應(yīng)用解決方案,集結(jié)產(chǎn)業(yè)伙伴之力,積極打造合作、共贏的物聯(lián)網(wǎng)生態(tài)圈,加速物聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用落地。